La gestion équilibrée et la protection des milieux aquatiques représentent les piliers incontournables d'une pratique de la pêche de loisir pérenne et de qualité.

LA GESTION PISCICOLE

C'est l'ensemble des actions à entreprendre, y compris celle qui consiste à ne rien faire, sur les peuplements de poissons. Elle œuvre pour la préservation de leur patrimoine génétique. Il s'agit de conserver et de transmettre un patrimoine naturel. Pour cela, l'état fonctionnel du milieu qui accueille le poisson doit être de qualité afin qu'il trouve les conditions de réalisation de l'ensemble de son cycle biologique (éclosion, croissance, reproduction).
La gestion des peuplements piscicoles passe par la gestion des milieux. Elle a pour objet d'organiser les relations entre les pêcheurs et les poissons.

LA GESTION PATRIMONIALE

La mission confiée aux gestionnaires de la pêche concerne une gestion patrimoniale des milieux aquatiques et des peuplements piscicoles qu'ils contiennent.
La gestion piscicole s'intègre donc dans la gestion durable des milieux. C'est un objectif de l'Etat, qui est de préserver les espèces dans leurs milieux. Plus précisement, il vise à conserver un équilibre entre milieu et espèces. Cet équilibre est différent de l'équilibre originel, car il tient compte de l'anthropisation, de l'exploitation, etc..., mais il vise à garantir la sauvegarde des espèces sensibles au sein de leur peuplement de référence.

Il s'agit de conserver et transmettre un patrimoine naturel, ce qui comprend :

. l'utilisation durable de la ressource,
. la protection des processus écologiques,
. le maintien de la diversité génétique.

Gérer de manière patrimoniale, c'est faire en sorte que les peuplements de poissons soient conformes à ce que l'on peut attendre du milieu naturel en bon état. La structure et la pérennité des peuplements naturels doivent être préservés.

La répartition entre espèces doit également être respectée et on ne doit pas favoriser une espèce par rapport aux autres :

. soit directement, en augmentant par exemple les effectifs par le repeuplement,
. soit indirectement, en modifiant le milieu pour le rendre plus favorable à une espèce qu'à une autre.

Dans ce mode de gestion, la demande de pêche est gérée en fonction de la ressource : le prélèvement par pêche doit être inférieur aux capacités de reproduction, afin de préserver le renouvellement naturel du stock. Les contraintes de développement de la pêche de loisir ne doivent pas être une cause de perturbation (les repeuplements par exemple).

Dans certains cas, le niveau du stock est très bas. Le renouvellement naturel des espèces les plus sensibles et les plus recherchées n'est plus possible en raison de la dégradation du milieu.
Une restauration des conditions favorables à un fonctionnement normal n'est pas envisageable à moyen terme (5 ans). Dans ce cas, la perturbation apportée par un développement de la pêche de loisir basé sur des repeuplements est supportable, car on peut considérer qu'elle est mineure par rapport aux autres perturbations.